Marmaray Projesi'nin ikinci etabı olan banliyö hatlarının üçe çıkarılması ve sistemin yenilenmesiyle ilgili ihale süreci tamamlanamayınca, Gebze-Haydarpaşa ve Sirkeci-Halkalı hattının geçici olarak durdurulması 2008'e kaldı.

Hatların, projenin ikinci etabı kapsamındaki işlerin başlamasından yaklaşık 15-16 ay sonra yani 2007 yılı sonunda kapatılacağı ilan edilmişti. Ancak ihale devam ettiği için inşaat aşamasına geçilemedi. Demiryollar, Limanlar ve Hava Meydanları (DLH) İnşaatı Genel Müdürü Ahmet Arslan, gecikmeyle ilgili şunları söyledi: "İhale süreci devam ettiği için henüz işin yapımına başlanmadı. Bu nedenle tren seferlerinin geçici olarak durdurulması 2008 yılının ilk yarısına kaldı."